首先，应保证企业自有资金能够直接保障企业正常经营和发展，财务管理工作应对自有资金的使用过程中加强监督和管理，并对资金管理制度进行健全和完善，使资金利用率最大程度提升。其次，财务管理部门应对企业经营过程中每笔资金的流入、支出过程中进行全程跟踪管理，确保资金使用流程的规范化，同时应对资金审批流程进行进一步细化，对管理责任予以明确，使企业资金管理实现安全化、规范化。
在中小制药企业财务管理工作中，保证相关人员财务管理意识增强的同时，还应对内部控制管理机制进行健全和完善。与其他企业相较之下，制药企业财务管理具有特殊性，对于财务管理人员而言，需要对自身管理工作的重要性提高认识，结合新时期发展要求，使自身财务管理理念不断更新和转变，促进财务管理制度的健全和完善，使财务管理有效性提升。
首先，企业财务管理人员需要对企业经营过程中各项业务活动加强关注，并确保财务管理工作能够贯穿其中，同时工作人员应保证自身职责能够有效落实，使财务管理水平切实提升。其次，需要对企业内部控制制度进行健全和完善，根据企业自身经营及生产特性，对相应管理流程进行规范，对生产、管理等职能部门的管理、监督、考核机制进行建立健全，并使各生产经营业务流程与具体财务管理监督工作能够有效结合。再次，需要对财务管理人员的一系列考核及监督机制进行建立和完善，对财务管理工作进行有效检查和监督，并全面分析财务管理工作内容的合理性，对工作内容进行不断优化，确保财务管理工作的有序开展，使财务人员工作效率和质量有效提升。最后，在企业财务管理过程中，应对相应的预算管理制度进行健全，对财务管理内容进行不断补充和完善，对企业资金及成本流向进行加强控制和管理，使资金使用效率进一步提高，并且通过预算管理制度的有效落实，切实提升企业财务管理的有效性。
在不少中小制药企业中，企业财务管理风险主要来自未严格按照国家相关法律法规执行，并且财务管理制度制定不健全，导致企业财务人员存在违法违规等不正当行为，导致企业遭受不必要的经济损失。因此，需要对企业运营及销售等重要环节的资金管理工作加强重视，并将其作为财务管理的重要内容，通过对资金加强统筹规划和分配，避免企业出现资金周转不灵等问题，有效提高企业财务管理成效。另外，企业财务管理人员应严格遵循相关资金管理制度，确保制度落实到位，还应对财务管理部门与其他部门及人员之间的关系加强协调，通过有效沟通和交流，使财务管理风险最大程度减少。随着市场竞争的日益激烈，中小企业需要对自身财务管理模式进行改革和优化，针对传统管理模式中普遍存在的财务人员专业性不足、流动性大、财务决策缺乏科学性、财务管理混乱等问题，需要通过全面预算管理制度的健全和完善，使企业财务管理运作有效性增强，为企业可持续发展提供有力支撑，同时能够有效防止企业运营过程中出现资金链断裂风险。
